土、水、火、そして風…世界の調和をもたらすクリスタル。その輝きが今、失われ、砕け散ろうとしていた。
「風が、変わった？」
チョコボに乗った旅人バッツ、タイクーン城の王女レナ、記憶を失った謎の老人ガラフ、美貌の海賊ファリス。
異変の前触れを感じ、それぞれの運命に従うように出会う4人。
クリスタルの導き、そして受け継ぐ心。強き意志を秘め、勇者達は冒険の旅に出る。

ジョブチェンジシステムがさらに発展、ジョブのレベルをあげると習得する「アビリティ」を自由に組替えて、独自のカスタマイズができるようになった。
イベント表現が大幅に進化。
泣き、笑い、悲しみを表現するドットキャラはRPGの物語性をさらに拡げ、のちに映像作品にまで発展するスタイルの方向性を示した。
戦闘を中心としたゲーム性とイベントで表現する物語性、このふたつを同時にあわせ持つファイナルファンタジーというシリーズが確立しつつある時代の作品。